SGI & Mitrionics: Sofrtwarelösung für die Bioinformatik

SGI und die Spezialprozessor-Softwarefirma Mitrionics haben in Boston auf der Messe Bio-IT World die weltweit erste schlüsselfertige Bioinformatik-Lösung auf der Basis der Field Programmable Gate Arrays-Technologie (FPGA) und der OpenSource-Software vorgestellt. Die im Sinne einer Appliance einsetzbare Innovation entwickelten die Unternehmen als Antwort auf die wachsenden Query-Belastungen, die sich angesichts der Verfügbarkeit neuester Sequenzierungsinstrumente und diverser anstehender Genom-Studien ergeben. Die Lösung arbeitet mit einer beschleunigten NCBI Blastn-Umgebung und zielt darauf ab, bei den Abfragen Engpässe und Staus zu durchbrechen und zu eliminieren. Blastn (Basic Local Alignment Search Tool for nucleotides) ist eine der weltweit meist genutzten Bioinformatik- Anwendung.